La région Bourgogne Franche-Comté est une collectivité territoriale dotée d'une administration et de services déconcentrés de l'État.
Le champ d'intervention de la région est très large. Il concerne notamment la gestion des lycées et celle des transports dits « régionaux », en passant par le développement économique du territoire.
En tant que collectivité territoriale, la région Bourgogne Franche-Comté a divers types de compétences :